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Support de cours Medline

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Ces pages sont des supports de cours, nécessitent des explications associées.

  1. Qu'est-ce que Medline?
  2. Comment interroger Medline sur l'Internet?
  3. Qu'est-ce que Pubmed?
  4. Qu'est-ce que Internet Grateful Med?
  5. Qu'est-ce que Medline Plus?
  6. Quels sont les différences entre les différents outils d'interrogation?
  7. Qu'est-ce que le MeSH, et comment rechercher un mot dans ce thésaurus?
  8. Je connais le terme en français, où puis-je en avoir sa traduction en anglais pour faire une recherche?
  9. Puis-je m'abonner à des services qui feraient les recherches pour moi?
  10. Je ne trouve que des abstracts dans Medline, et pas toujours. Comment obtenir les articles complets?
  11. Comment sauvegarder mes recherches?
  12. Comment insérer des références dans un document Word?
  13. rouge.gif (871 octets) Le New Pubmed de la NLM utilise les cookies. Qu'est-ce que c'est?
Qu'est-ce que Medline? Top

La base de données la plus populaire dans le domaine de la santé est probablement MEDLINE (MEDlars on Line) qui est la partie visible en temps réel (on line) du système global MEDLARS (MEDical Literature Analysis and Retrieval System) développé aux États-Unis par la National Library of Medecine, NLM, Bethesda, USA.

Medline couvre les références à tous les articles de biomédecine publiés dans plus de 4'300 journaux ou revues de plus de 80 pays, soit 11 millions de références depuis 1966.  Consulter Journal Database Browser de PubMed qui donne accès aux titres, abréviations et ISSN des revues indexées dans Medline.

Outre la référence à l’article, Medline fournit aussi le résumé (l’abstract) complet dans plus de 70% des cas.

En accès direct sur Internet, de multiples adresses vous permettent d’accéder à la base de données.
Comment interroger Medline sur l'Internet? Top

MEDLINE est accessible par l'intermédiaire de  moteurs de recherche.

Le site très connu de la NLM est

Chaque requête sur l'un de ces moteurs de recherche qui donne lieu à résultat vous fournit:

  • le titre de l'article, ses auteurs, la langue de publication, le nom de la revue et toutes ses références bibliographiques, un "abstract" (résumé) toujours en anglais, les références à la bibliothèque de la NLM, et si vous le désirez les clés du code ayant permis l'indexation du ou des articles trouvés en MeSH.

Quel que soit le moteur de recherche utilisé (Pubmed,  Knowledge Finder, on interroge la même base de données, les résultats doivent être identiques. Les différents outils ont une interface plus ou moins conviviales, avec des subtilités propres à chacun.

Medline ne couvre pas la littérature médicale du monde entier. Aucune base de données n’est exhaustive, et selon les sujets, si Medline donne peu de résultats, il conviendra de s’orienter sur d’autres bases comme Aidsline, Embase, Toxline, etc.

En aucun cas, une recherche infructeuse sur Medline permet d’affirmer qu’il n’existe pas de références dans la littérature sur un sujet donné.

Medline Plus présente depuis septembre 98, des sujets de santé publique pour le grand public. Depuis Medline Plus, tout un chacun peut d'un seul clic, accéder aux derniers articles de la littérature indexés  dans Medline  grâce à des recherches préparées par la NLM.

Accès à Medline Plus : http://www.medlineplus.gov
Contenu d'une référence Medline Top
TITLE:  [Results of a combined adult-child liver transplantation in Switzerland]
VERNACULAR TITLE:  Resultats d'un programme de transplantation hepatique combine adultes- enfants en Suisse.
AUTHORS:  Mentha G; Le Coultre C; Giostra E; Belli D; Huber O; Rubbia-Brandt L; Hadengue A; Morel P
AUTHOR AFFILIATION:  Unite de transplantation, Hopitaux Universitaires de Geneve.
SOURCE:  Schweiz Med Wochenschr 1999 Mar 20;129(11):433-40
CITATION IDS:  PMID: 10226324
UI: 99242911
ABSTRACT:  Between July 1987 and August 1998, 173 orthotopic liver transplantations (OLT) [....]
MAIN MESH HEADINGS:  Liver Transplantation/*statistics & numerical data
Organ Procurement/*organization & administration
ADDITIONAL MESH HEADINGS:  Adult
Child
English Abstract
Europe
Graft Rejection/epidemiology
Human
Liver Diseases/classification
Liver Diseases/surgery
Liver Transplantation/mortality
Liver Transplantation/physiology
Postoperative Complications
Registries
Reoperation
Retrospective Studies
Survival Rate
Switzerland
Time Factors
PUBLICATION TYPES:  JOURNAL ARTICLE
LANGUAGES:  Fre
Qu'est-ce que le MeSH, Medical Subject Headings? Top
Chaque article est indexé par la NLM à l’aide de mots clefs MeSH (Medical Subject Headings), vocabulaire contrôlé de 45'000 termes médicaux et catégories et plus de 37'000 synonymes et termes acceptés organisés hiérarchiquement.

Une douzaine de mots clefs en moyenne sont utilisés par référence. Certains mots clefs sont obligatoires : appelés « check tags », il permettent par exemple de limiter une recherche à des tranches d’âge spécifiques. Les mots clefs sont fréquemment suivis d’un qualificatif permettant d’en préciser le sens.

Exemple : sciatica/surgery ou sciatica/su. Il est rare de trouver plus de 3 qualificatifs affiliés à un mot clef.

De la nécessité d'utiliser les mots clefs MeSH

La réponse du CHU de Rouen : 
http://www.chu-rouen.fr/documed/pme.html#UTILITE MESH

Pour trouver un mot clef MeSH

Il y a plusieurs "browsers" du MeSH disponible sur l'Internet
Traduction d'un terme MeSH Top
Il y a plusieurs sites sur lesquels vous pouvez trouver des traductions de mots clefs:
  1. INSERM et son MeSH traduit, et les nouveaux termes du MeSH 2000
  2. HON select  Health On the Net http://www.hon.ch/HONselect/index_f.html
Puis-je m'abonner à des services qui feraient les recherches pour moi? Top

Vous pouvez réaliser votre profil sur PubMed et recevoir chaque lundi vos références par e-mail. En les sauvegardant au format html, vous pourrez les relire dans Netscape ou Explorer
Je ne trouve que des abstracts. Comment commander les articles? Top
Les abstracts (résumés) sont disponibles pour environ 70 % des références Medline. Certains articles possèdent un lien direct vers le site des éditeurs, ceux qui ont passé des contrats avec Pubmed. Si vous trouvez une telle référence, cliquer sur le lien de l'éditeur. Parfois, mais cela dépend de la politique du journal, vous aurez accès à l'article complet (Exemple : BMJ ou NEJM) Dans la majorité des cas, il vous faut un code d'accès, que vous obtenez en vous abonnant au journal!

Il est prohibitif de commander l'article aux USA en cliquant sur le bouton ORDER. (Abonnement en ligne possible) Par contre, vous pouvez commander l'article à la bibliothèque universitaire la plus proche.

Par exemple, pour la bibliothèque de la faculté de médecine de Genève, cliquer ici pour savoir comment procéder.
Comment sauvegarder mes recherches? Top
  1. Méthode simple
    • Faire une recherche avec PUBMED
    • Cliquez sur le bouton Details
    • Ciquez sur URL
    • Ajoutez cette page à vo signets ou favoris, lui donner un nom parlant (Exemple: dernières publications sur l'obésité et ses traitements)
  2. Utiliser la nouvelle fonction Cubby de Pubmed, lire la page d'aide en anglais.
  3. Biomednet (Gratuit mais enregistrement obligatoire) permet de conserver l'historique des recherches
  4. Knowledge Finder (Intranet des HUG) permet d'enregistrer les recherches sur son disque local. (Voir mode d'emploi KF sur l'Intrante HUG)
Comment insérer des références bibliographiques dans un document Word? Top
Des logiciels spécifiques permettent de créer des librairies de références, de les insérer facilement dans votre texte Word : ce sont les logiciels de gestion et mise en forme des références bibliographiques.

Pour en savoir Plus :

NewPubmed et les cookies Top
La nouvelle version de Pubmed, appelée NewPubmed est en fonction depuis septembre 99, et devrait remplacer Pubmed dès le 1er mars 2000. Un message sur le la page d'accueil nous informe que ce lancement est retardé en raison de la difficulté de certains utilisateurs à utiliser les cookies. 

Qu'est-ce qu'un cookie? (témoin)

Un témoin est un très petit fichier de type texte (.txt), qui s'inscrit dans votre disque dur à partir de certaines pages Web dans le but d'être réutilisé plus tard par d'autres pages Web. 

Ce ne sont que des fichiers de type texte qui restent stockés dans votre disque dur. Toute information personnelle contenue dans un témoin se limite à celle que vous avez fournie de votre plein gré, comme lorsque vous remplissez un formulaire sur une page Web ou demandez plus de renseignements sur l'article que vous désirez acheter en ligne.

L'accès à l'information contenue dans un fichier « cookie.txt » demeure également très limité. Si une page d'un site Web sauvegarde de l'information contenue dans votre fichier « cookie.txt » (stocké dans votre disque dur), une page d'un autre site Web ne peut pas avoir accès à cette information.

POur en savoir plus: La réponse complète d'Iprolink ou de sympatico

Où sont stockés les cokies dans mon ordinateur?

Les pages de la CNIL vous l'expliquent. Netscape et MS EXplorer ne les stockent pas de la même manière, ni au même endroit.

Comment accepter les cookies pour utiliser NewPubmed et sa fonction historique?

  • IE 5.0 : Menu Outils, option Internet, sécurité, activer les cookies
  • Netscape >4.5 : Menu Edition, préférences, avancées, autoriser les cookies

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